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科学网什么是锌指卵白?

锌是众所周知的一种微量元素,人对锌的需求量固然远远比铁,钙,钾,钠等元素要少,但缺锌会引起一系列疾病,好比食欲不振、发展停滞、嗅觉痴钝、性成果发育不全等。锌是在铁之后第二大存在于生物体内的过渡金属元素,所谓过渡金属就是在元素周期表中位于D区的一系列金属元素,他们的可变价态较量多,可以与数目差异的配体形成不变的共同体,这也是铁,锌,钴等过渡元素被卵白质选择行使的一个重要的缘故起因,因此经常是许多酶的活性位点的必需因素,锌经常会以锌指卵白的情势参加体内基因表达,维持卵白质和核酸的布局,细胞内分子运输和免疫等的使命。此刻已经发明近300种酶都有必要锌的参加才气利用成果。好比说过氧化物酶,有一个直接打仗的锌团结位点,假如用螯合剂抢走锌就会使卵白质完全失去浸染。


由于最初发明的锌指卵白(zink finger)长得像手指,许多人以为像手指一样的卵白才应该叫锌指卵白,但此刻这个界说早已被不绝发明的同类卵白质给扩大化了。锌指卵白一样平常指的是全部必要团结锌才气正常利用成果的一类卵白质。锌指卵白没有牢靠的布局和浸染,他们一样平常在调控基因表达,不变布局方面施展浸染。


锌指卵白的包围范畴很广,国际体系分类法把现有的酶分为六种:


氧化还原酶类(oxidoreductase)

转移酶类(transferases)

水解酶类(hydrolases )

裂解酶类(lyases)

异构酶类(isomerases)

合成酶类(ligase)


锌指卵白涵盖了全部六种酶类,并且在动物,植物,细菌和病毒中都有锌指卵白,就像人类会用火一样,大天然在很早早年就会行使锌了。


锌指卵白的活性位点可以被凭证布局上的不同分为许多类,可是从序列上来看,绝大大都的锌指卵白配体都是大同小异。假如按布局分类的话,可以被大致地分为八种,C2H2,枢纽型,高音谱号型等等,都别离由一到四个螺旋,折叠,乃至是无法则的环构成,这些活性位点的布局固然各异,但在序列上有很是守旧的处所,最守旧的几个氨基酸也就是与锌形成配位键的几个氨基酸。在现有的常识里,只有四种氨基酸可以有强力团结锌的手段,在统计上来看,与锌团结最多氨基酸残基按次序该当是HIS的咪唑基,glu和asp的羧基,cys的巯基,在许多环境下锌和可以和周围的水分子形成配位键。除了这些之外,ser, thr, lys 和trp也可以用羰基来薄弱地团结锌离子。


下面就是一个锌指卵白M23在VMD里的布局,中间谁人绿色小球就是锌原子,万博体育app,这个卵白名字叫1QWY,有乐趣的话可以去pdb里搜刮一下,PDB的官网是rscb.org。不外,假如想在vmd里表现锌原子的话,必要把卵白质分子复制一遍,用差异的表现方法表现锌原子,有乐趣的话试试吧


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